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  1. arXiv

    BARseq不再需要人工标注：用仪器光学模型造训练图，每个细胞多回收约4条转录本

    PhySeqNet用仪器匹配的光学模型加真实空帧噪声生成半合成图像来训练U-Net检测器，无需人工标注即可在BARseq组织图像上定位荧光rolony，配合条形码感知非极大值抑制后每个细胞回收51条计数，高于BarDensr的47条。

    Allen Institute for Brain ScienceCold Spring Harbor Laboratory
    Neha Goswami（第一作者）Anthony M. Zador（通讯作者）
    PhySeqNet物理信息深度学习pyBARseq空间转录组学U-Net

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