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# 腺苷到肌苷RNA编辑

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  1. Cell Discovery

    RNA编辑位点不再只靠A到G信号:双酶法加InoDREAM,在HEK293T细胞给出59万余个高置信肌苷位点

    RNA肌苷位点的定位长期依赖测序中A到G的碱基转换,难以与DNA突变和测序错误区分。REX-seq把EndoV对肌苷的切割与XRN-1只降解带5′磷酸末端的片段结合起来,在保留基因表达定量的同时给出切割信号;在HEK293T细胞中识别出590,249个高置信肌苷位点,其中84,645个为此前未报道的新位点。以这批位点训练的InoDREAM在留出测试集上取得AUROC 0.965、平均精度0.964,对照EditPredict为0.921和0.890。

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