RNA逆折叠不再只看骨架:把分子表面当设计约束,三个基准序列回收率均居首
RNA逆折叠要从目标三维结构反推核苷酸序列,此前方法主要依赖二级结构和骨架拓扑,很少把决定分子间相互作用的分子表面纳入约束。gRFold把表面点云、骨架图和二级结构经分层交叉注意力融合,再驱动自回归解码,并在推理时按折叠结果与目标碱基配对的一致性重排候选。在RNA-蛋白复合物、单体RNA和RNA-Puzzles三个基准上,gRFold的序列回收率分别为49.65%、51.67%和45.00%,均为所比较方法中最高;消融显示表面分支与骨架分支贡献互补。