长上下文调控模型跨物种失效：20 kb 上下文在鱼类距离反成负担，1 kb 局部序列仍可迁移
FunFormer 把 20 kb 序列压成固定数量 token 做二分类调控活性预测，并配一个架构与参数量完全相同、只读中心 1 kb 的对照，在六种脊椎动物间互相迁移。种内 20 kb 版本在全部六个基因组上平均 AUROC 都最高，比三个已发表 1 kb 基线高 1.0 到 3.8 个百分点；但跨物种时这部分上下文收益随分化衰减，到羊膜动物分歧处接近零，在 320 到 435 百万年间反转为负，而 1 kb 模型仍能迁移进鱼类。