# SVC空间虚拟嵌入细胞模型

亚细胞分辨率空间转录组能测到转录本在细胞内的位置，但此前的方法多针对单一分析任务，缺少在细胞类型与组织环境中统一刻画并预测基因胞内定位的框架。SVC 把每个基因在细胞内的空间表达当作一张图像块，用同一细胞的其他基因作为上下文，以自监督掩码方式学习跨基因的空间依赖。在 seqFISH+ 小鼠胚胎成纤维细胞数据上，SVC 对未测基因的亚细胞模式预测在六项指标上均优于四个图像基线，相对更具挑战性的基线组中位提升为 5.2%–21.0%。

亚细胞分辨率空间转录组能测到转录本在细胞内的位置，但此前的方法多针对单一分析任务，缺少在细胞类型与组织环境中统一刻画并预测基因胞内定位的框架。SVC 把每个基因在细胞内的空间表达当作一张图像块，用同一细胞的其他基因作为上下文，以自监督掩码方式学习跨基因的空间依赖。在 seqFISH+ 小鼠胚胎成纤维细胞数据上，SVC 对未测基因的亚细胞模式预测在六项指标上均优于四个图像基线，相对更具挑战性的基线组中位提升为 5.2%–21.0%。