空间转录组里邻居的转录本混进来了:DisCell把溢出与微环境响应拆开,并给每个结论算出失效点
单细胞分辨率的空间转录组会把邻近细胞的转录本计入本细胞,这种溢出与细胞对微环境的真实响应都会让表达随周围环境变化,仅凭计数无法区分。DisCell把每个细胞拆成内在状态、微环境响应和溢出三项联合建模,在一系列溢出比例下重新拟合,并给出每个结论的失效点。在卵巢与肺组织切片上,其内在状态保留的细胞周期信息多于任何同等保留邻域信息更少的对照方法;一项已发表的食管癌上皮–间质转化结论在建模溢出范围内依然成立。