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Xiao Zhou

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  1. bioRxiv

    蛋白语言模型嵌入里藏着糖基化位点:MaskNGly不训练也能在N-GlyDE上达到AUC 0.940

    MaskNGly把蛋白语言模型嵌入当作可读的共进化信号来源,用遮罩-探测的方式直接判断N-X-S/T序列子是否会被N-糖基化,不依赖标注数据训练。在N-GlyDE测试集上,它的AUC为0.940、MCC为0.808,与已发表的监督式神经网络预测器相当;在独立糖蛋白组数据中,111个此前未报道的位点有106个得分超过0.5阈值。

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