Haoyu Yang

常规单细胞与空间转录组的3′端测序本为计数基因表达而做，其中少量带多聚腺苷酸尾的读段其实标出了RNA末端位置。scPolyA把这类读段用于从头发现多聚腺苷化位点，再用总读段覆盖度划定计数区间，输出逐细胞或逐空间位点的末端使用率、3′UTR长度与内含子多聚腺苷化指标。在八个单细胞数据集上，其位点与PolyA_DB 3参考图谱的中位一致率为63.3%，高于polyApipe、scAPAtrap、Sierra和SCAPE，与采用DeepPASS序列过滤的SCAPTURE相近。

常规单细胞与空间转录组的3′端测序本为计数基因表达而做，其中少量带多聚腺苷酸尾的读段其实标出了RNA末端位置。scPolyA把这类读段用于从头发现多聚腺苷化位点，再用总读段覆盖度划定计数区间，输出逐细胞或逐空间位点的末端使用率、3′UTR长度与内含子多聚腺苷化指标。在八个单细胞数据集上，其位点与PolyA_DB 3参考图谱的中位一致率为63.3%，高于polyApipe、scAPAtrap、Sierra和SCAPE，与采用DeepPASS序列过滤的SCAPTURE相近。