SHERLOCK 将扰动效应建模为潜状态上的结构化干预,在 CRISPR、化学与空间扰动数据中恢复通路关系并预测组合效应
作者提出 SHERLOCK,一个可解释的深度生成框架,把遗传与药物扰动表示为潜基线细胞状态上的结构化干预,学习相关且稀疏的扰动表征,并在显式可识别性假设下对下游转录效应做反事实估计,同时量化条件依赖响应并以组合方式建模组合扰动;在基因组规模 CRISPR、化学与空间扰动数据上,该框架恢复了与已知生物通路和药理性质一致的扰动关系,识别出条件依赖响应,并预测了组合扰动效应。
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作者提出 SHERLOCK,一个可解释的深度生成框架,把遗传与药物扰动表示为潜基线细胞状态上的结构化干预,学习相关且稀疏的扰动表征,并在显式可识别性假设下对下游转录效应做反事实估计,同时量化条件依赖响应并以组合方式建模组合扰动;在基因组规模 CRISPR、化学与空间扰动数据上,该框架恢复了与已知生物通路和药理性质一致的扰动关系,识别出条件依赖响应,并预测了组合扰动效应。
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