转录因子协作图谱揭示基序读取者如何塑造调控输出
该研究利用多智能体系统ARES分析10种细胞类型中的1,552个转录因子结合数据集,检验特定细胞环境下转录因子-基序依赖的竞争机制,发现推断出的机制收敛于直接序列识别、蛋白介导的招募或排斥以及调控背景三条路径,且目标转录因子结合的预测性基序仅三分之一由传统“经典”转录因子读取,基序相似性与共享调控区域类型相关但不与共享转录结果相关,而读取者身份与两者均相关,从而将基序身份、读取者身份与调控输出区分开来。
1 篇关联报道
该研究利用多智能体系统ARES分析10种细胞类型中的1,552个转录因子结合数据集,检验特定细胞环境下转录因子-基序依赖的竞争机制,发现推断出的机制收敛于直接序列识别、蛋白介导的招募或排斥以及调控背景三条路径,且目标转录因子结合的预测性基序仅三分之一由传统“经典”转录因子读取,基序相似性与共享调控区域类型相关但不与共享转录结果相关,而读取者身份与两者均相关,从而将基序身份、读取者身份与调控输出区分开来。
已读完全部报道