REXzyme 把化学反应当源语言翻译成酶序列,甲酸脱氢酶设计 C20 比活达野生型 2.5 倍
酶工程长期依赖定向进化,单点突变中只有不到 5% 有益,却要筛选成千上万个变体。REXzyme 把酶设计改写成一个翻译任务:编码器读入以 SMILES 书写的反应,解码器逐字生成氨基酸序列,模型在约 2100 万对反应—酶序列上训练。针对甲酸脱氢酶催化二氧化碳还原这一逆向反应,经家族特异微调和强化学习对齐后生成的 20 个设计全部可溶表达并具还原活性,其中 C20 的比活达到 80.8 mU/mg,为野生型 CtFDH 的 2.5 倍。