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Jose Nimo

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  1. Nature Methods

    空间蛋白组学不再依赖商业软件:开源流程把取样速度提高约百倍,还能按细胞邻域取样

    深度视觉蛋白组学(DVP)此前缺少开源端到端流程,限制了推广与系统评测。openDVP把图像处理、细胞表型、激光显微切割与质谱蛋白组学串成模块化流程,并提供无需图像分析经验的快速通道。在胎盘、早期肺癌与复发乳腺癌三份存档组织上,按细胞邻域取样比逐细胞取样快约100倍,蛋白鉴定数平均提高26%。

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