SpatialTRACE 用少量标注把空间转录组注释扩展为全切片解剖轴与区域图谱，并仅凭 DAPI 图像预测同一坐标
作者开发了 SpatialTRACE，包含基于图与基于图像的两类模型：SpatialTRACE-Graph 结合基因表达谱与空间邻域，在小鼠小肠切片中仅用 10 个已标注绒毛即可预测隐窝-绒毛轴与上皮距离轴坐标并识别 Peyer 斑；SpatialTRACE-Image 作为多尺度视觉 Transformer，从 SpatialTRACE-Graph 生成的坐标与区域预测中学习，仅凭 DAPI 即可在全组织图像上预测相同解剖轴坐标与区域，并被用于免疫荧光图像中定位 LCMV Armstrong 急性全身感染下抗原特异性 P14 CD8 T 细胞，显示视黄酸受体抑制剂处理切片相较溶剂对照整体 T 细胞更少、上绒毛固有层比例更低而肌层相对