调控先验引导的注意力机制在非配对单细胞RNA-ATAC整合中保留生物结构
该工作提出 scHPGT——一种单细胞异质先验引导 Transformer,用模态特异编码器、基于调控连接约束基因-峰注意力的先验引导跨模态 Transformer 以及域对抗目标,在共享隐空间中整合非配对 RNA 与染色质可及性图谱,并在 PBMC3k、小鼠脾脏、CITE-seq/ASAP-seq PBMC 与 PBMC10k 基准上改善聚类一致性、标签迁移与生物结构保留,同时在部分重叠与条件漂移场景中避免把未匹配或条件特异状态强行对应,且注意力导出的连接可恢复调控关系、标记基因调控区、转录因子程序与调控活性谱。