A. Ercüment Çiçek

RPI-Zero 把全长蛋白与整条剪接转录本放进同一个输入，只凭序列给出结合概率，不需要结构，也不需要新分子的相互作用数据。它配套的基准来自四个公共数据库、11.6 百万条 CLIP 峰、209 个蛋白，按序列相似性整簇划分训练与测试，并让负例在长度和转录本“热门程度”上与正例匹配。在未见 RNA、未见蛋白和未见配对三个测试切片上，它的 AUPRC 分别为 0.753、0.637 和 0.589，比各自切片上第二名方法高 2.7%、7.4% 和 4.6%。

RPI-Zero 把全长蛋白与整条剪接转录本放进同一个输入，只凭序列给出结合概率，不需要结构，也不需要新分子的相互作用数据。它配套的基准来自四个公共数据库、11.6 百万条 CLIP 峰、209 个蛋白，按序列相似性整簇划分训练与测试，并让负例在长度和转录本“热门程度”上与正例匹配。在未见 RNA、未见蛋白和未见配对三个测试切片上，它的 AUPRC 分别为 0.753、0.637 和 0.589，比各自切片上第二名方法高 2.7%、7.4% 和 4.6%。