不用单细胞测序也能拆开肿瘤内部：批量RNA推断恶性细胞状态，33种癌症里找到193个
肿瘤内部不同恶性细胞状态共存，单细胞测序能分辨但成本高、难以上规模，而批量RNA测序便宜却需要把混合信号拆开。CDState用带比例归一约束和余弦相似度惩罚的非负矩阵分解，在不需要参考数据的情况下从批量RNA中推断恶性细胞状态；在五种癌症的模拟批量数据上，它估计状态表达和比例的总体表现优于现有无监督方法。把它用于TCGA的33种癌症、9,669个样本，得到193个恶性细胞状态，其中上皮–间质转化、MYC靶基因和氧化磷酸化是最常见的反复出现的程序。