Haihui Zhang

组合扰动实验的配对数量随扰动数平方增长，绝大多数组合无法测量，而组合的转录响应往往不等于两个单扰动效应之和。GrnPFN 先在随机基因调控网络生成的模拟筛选中预训练，直接预测这一非加性残差，再通过上下文学习纳入已测配对而不更新权重。在五个单细胞筛选上，目标筛选没有任何已测配对时，其合并余弦相似度比在其他筛选上训练的梯度提升高 0.049（97.5% 置信区间 0.038–0.060）；已测配对增多后，拟合到同一批配对的核岭回归追平。

组合扰动实验的配对数量随扰动数平方增长，绝大多数组合无法测量，而组合的转录响应往往不等于两个单扰动效应之和。GrnPFN 先在随机基因调控网络生成的模拟筛选中预训练，直接预测这一非加性残差，再通过上下文学习纳入已测配对而不更新权重。在五个单细胞筛选上，目标筛选没有任何已测配对时，其合并余弦相似度比在其他筛选上训练的梯度提升高 0.049（97.5% 置信区间 0.038–0.060）；已测配对增多后，拟合到同一批配对的核岭回归追平。