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Junchao Zhu

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  1. arXiv

    3D空间转录组不再逐点密采:稀疏取样加三路预测,HER2上相关系数达0.361

    三维空间转录组测序成本高,常规做法是按固定网格密集取样,在三维组织里容易重复测量、又漏掉信息集中的区域。STRATA把取样和预测放在同一个预算约束下联合优化:在融合H&E形态与单细胞先验的三维图上,用强化学习智能体挑选形态稀疏、转录组信息量高的位点,再由检索、回归与跨层插补三路预测器按位点自适应加权补全。在HER2、Breast、cSCC与私有Kidney队列上,STRATA的PCC最高、MSE最低;HER2上其PCC为0.361、MSE为0.356,正文所述最强基线数值与表格所列基线数值不一致,此处不引用该对比。

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