整合代谢组学、孟德尔随机化与机器学习,研究锁定苯丙氨酸及其转运体SLC6A14作为胰腺癌诊断与治疗候选靶点
该研究整合血浆代谢组学、孟德尔随机化与机器学习,在55种血浆代谢物中确认苯丙氨酸与胰腺癌存在因果关联(IVW OR=1.641,95% CI 1.052–2.562,p=0.029),据此筛选出8个相关差异基因并用12种算法共113种组合构建随机森林诊断模型(训练集AUC 0.994,三个外部验证集AUC 0.918、0.983、0.923),再以SHAP锁定SLC6A14为核心基因,通过单细胞测序、模拟基因敲除、分子对接与动力学模拟提示染料木素(genistein)可稳定结合SLC6A14,并在BxPC-3与HPDE6-C7细胞对中用RT-qPCR验证了5个建模基因的高表达。