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Junhui Gao

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  1. arXiv

    细胞世界模型的高相关分数被拆穿:GEARS全局皮尔逊0.977,扰动增量上只有0.076

    在Replogle K562的509个未见扰动上,GEARS预测转录组与观测的全局皮尔逊相关达0.977,但把对照基线减掉、只看扰动引起的增量后只剩0.076;对每个扰动都预测训练集平均增量的平凡基线反而达到0.267。这一差距源于全局相关被数千个不响应基因主导,因此增量空间评估被提为主要基准,并给出两种无需重训的事后校正与一个定位残差来源的检索上界。

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