Changping Laboratory

蛋白质功能取决于构象状态之间的有序转换，而分子动力学模拟在成批蛋白上反复采样代价高昂。TEMPO把生成分成两级：慢尺度模型按训练时的20纳秒步长推进锚点构象，快尺度模型在锚点条件下生成间隔1纳秒的帧。在留出的mdCATH与ATLAS蛋白上，它复现了MD系综观测量；相比单尺度自回归模型，400帧长程RMSD误差从8.62埃降到1.78埃，一次400帧推演不到1分钟。

蛋白质功能取决于构象状态之间的有序转换，而分子动力学模拟在成批蛋白上反复采样代价高昂。TEMPO把生成分成两级：慢尺度模型按训练时的20纳秒步长推进锚点构象，快尺度模型在锚点条件下生成间隔1纳秒的帧。在留出的mdCATH与ATLAS蛋白上，它复现了MD系综观测量；相比单尺度自回归模型，400帧长程RMSD误差从8.62埃降到1.78埃，一次400帧推演不到1分钟。