湿地松育种不再只靠表型:按训练折做关联预选,生长性状预测能力提高11.9%
湿地松育种周期长达十几年,基因组选择能否加速取决于标记怎么选。一项针对240株湿地松的研究把全基因组关联分析限制在每个训练折内部,用关联显著性预选SNP,再比较八种预测模型和十二种标记密度。生长性状的平均预测能力从随机选标记的0.242升到0.271,提高11.9%;木材品质仅提高2.2%,松脂性状没有变化,而按PVE或跨折重现频率加入的QTN协变量在12个性状中有9个未超过无协变量基线。
湿地松育种周期长达十几年,基因组选择能否加速取决于标记怎么选。一项针对240株湿地松的研究把全基因组关联分析限制在每个训练折内部,用关联显著性预选SNP,再比较八种预测模型和十二种标记密度。生长性状的平均预测能力从随机选标记的0.242升到0.271,提高11.9%;木材品质仅提高2.2%,松脂性状没有变化,而按PVE或跨折重现频率加入的QTN协变量在12个性状中有9个未超过无协变量基线。
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