CRISPRi 引导效力模型跨库失效:换掉基因内百分位标签,迁移相关从0.008升到0.136
在K562细胞上训练的CRISPRi引导效力模型,直接用于Sanson等2018年的Dolcetto独立文库(HT29与A375细胞)时几乎不迁移,Spearman相关仅0.008和0.012。保持101个特征、模型结构和超参数不变,只把训练标签从基因内百分位改为连续的跨研究z分数,同一模型在HT29和A375上的迁移相关升至0.136和0.158,K562留一染色体交叉验证也从0.375升到0.429。这说明跨库迁移失败主要来自标签设计,而不是染色质特征缺失。