皮肤微生物组补上参考基因组缺口:45万基因组里近六成物种此前无参考
人体皮肤微生物组的参考基因组长期偏少,非细菌类群和全球菌株变异尤其缺失。全球皮肤宏基因组数据资源整合了12409份新测序与4396份公开皮肤宏基因组及3077份分离株基因组,重建出452397个宏基因组组装基因组,并新增42758个此前未表征的分类单元。在此基础上,17.1亿条预测蛋白序列被归并为1272886个蛋白家族,其中79434个在Pfam与RefSeq中均无同源命中。
4 篇关联报道
人体皮肤微生物组的参考基因组长期偏少,非细菌类群和全球菌株变异尤其缺失。全球皮肤宏基因组数据资源整合了12409份新测序与4396份公开皮肤宏基因组及3077份分离株基因组,重建出452397个宏基因组组装基因组,并新增42758个此前未表征的分类单元。在此基础上,17.1亿条预测蛋白序列被归并为1272886个蛋白家族,其中79434个在Pfam与RefSeq中均无同源命中。
研究对英国生物银行24,638名糖尿病前期参与者,用LASSO与弹性网络从核磁共振代谢组学标志物中筛出16项指标,再以k均值聚类在训练集(12,322人)中分出低、中、高代谢风险三个亚型,并在验证集(12,316人)中验证其2型糖尿病、心血管病和慢性肾病风险依次升高,同时发现饮食质量与结局的关联在不同亚型间存在差异,并以孟德尔随机化提示若干代谢标志物与结局可能存在因果联系。
该研究让八个大语言模型(ChatGPT-5.5 Instant、Claude Sonnet 4.6、Gemini 3 Flash、Grok 4.20、Microsoft Copilot、Doubao Seed 1.8、DeepSeek-V4、Qwen 3.6)在连续三天回答十个面向患者的胰腺癌问题,由五名对平台身份设盲的评估者对全部240条回答按六个临床质量维度打分(共1200条评分),发现各平台总体表现存在差异,Grok 4.20与DeepSeek-V4平均分最高、Doubao Seed 1.8最低,差异在可操作性与具体性上最明显,相邻日分数波动以Doubao Seed 1.8和Qwen 3.6最突出,但经多重检验校正后没
本研究以cerastecin Cpd 4为模板,利用Link-INVENT与AutoMolDesigner两种人工智能工具进行分子设计与化学衍生化,发现靶向MsbA的小分子Y-11,其对鲍曼不动杆菌的MIC为0.5 g/mL,对碳青霉烯耐药菌株效力与Cpd4相当,且细胞毒性与溶血性更低、自发耐药频率更低,在小鼠感染模型中可有效降低细菌负荷,机制研究提示Y-11可能通过竞争性结合MsbA底物结合位点并调节ATP酶活性,抑制脂寡糖转运并破坏外膜形成。
已读完全部报道