Multi-ISM 以少 45 倍模型评估量完成 5000 个基因的饱和突变扫描,并提升罕见变异表达预测
该工作提出 Multi-ISM,将计算机饱和突变(ISM)重构为稀疏恢复问题,用比逐变异穷举 ISM 少 45 倍的模型评估量生成突变图谱,在变异效应基准上达到或超过其精度,并应用于 5000 个蛋白编码基因(含 3317 个 OMIM 疾病基因),在 500-kb 窗口内生成碱基分辨率、组织分辨的归因图谱,用于增强子—基因优先级排序和细胞类型特异调控元件识别,其基因水平汇总显示受约束更强的基因预测突变效应更小,将预测聚合为基因水平罕见变异负荷后相较常见变异弹性网改善了表达预测,在表达离群样本上增益最大。