Strand AI公开TCGA结肠癌虚拟空间蛋白图谱：442张H&E切片可在线浏览七种标记预测
核心概要
Strand AI 将虚拟染色模型 Lattice 用于 TCGA 结肠腺癌队列，为 442 张诊断用 H&E 切片生成空间蛋白预测图并公开。资源覆盖 CD3e、CD8、CD20、CD68、Ki67、CD45、PanCK 七种蛋白标记与 DAPI，可在同一视野内对照原始组织与预测通道，无需登录即可浏览，也可经 Hugging Face 或 Python SDK 取用。发布方称这些预测在该队列中带有预后信号，细节尚未公布。
深度剖析
结肠腺癌公共队列的组织切片现在有了配套的预测空间蛋白图谱，研究者可以在同一视野里把原始 H&E 染色与预测的蛋白通道并排查看。 此前该队列公开的是诊断用 H&E 切片本身，蛋白层面的空间信息需要另行测量。 这批图谱覆盖 TCGA-COAD 队列的 442 张诊断 H&E 切片，由虚拟染色模型 Lattice 生成。
图谱以逐像素预测的方式给出蛋白标记的空间分布，而不是对整张切片给一个汇总数值。 虚拟染色模型 Lattice 把 H&E 图像映射为指定蛋白标记的预测信号，本次运行选取七种标记加 DAPI。 纳入的标记为 CD3e、CD8、CD20、CD68、Ki67、CD45、PanCK 与 DAPI，浏览界面支持平移、缩放和通道切换。
资源以可复现取用的形式发布，附带元数据与下载样例。 预测结果与元数据采用 CC BY-NC 4.0 许可，要求署名并排除商业使用，商业用途需联系 Strand AI。 原始 H&E 切片仍由 NCI 基因组数据共享平台按 GDC 数据政策提供，资源标注为仅供研究使用，不用于临床或诊断流程。
启示与展望
已展示的范围是 TCGA-COAD 队列的 442 张诊断 H&E 切片及其七种蛋白标记加 DAPI 的预测图，面向研究用途，发布方明确不用于临床或诊断流程。
发布方表示这些预测在该队列中带有预后信号，但称细节稍后公布，目前没有给出具体分析或数值。