New Biotechnology 2026年9月14日该研究将 mRNA 稳定性作为可调控的密码子优化设计参数,构建 IgG1 轻链同义编码序列组合文库并单拷贝整合到 CHO 细胞固定基因组位点,用 gDNA 与 mRNA 深度测序得到的稳态 mRNA 丰度作为稳定性代理指标,训练基于预训练核苷酸 transformer 嵌入的丰度预测模型,并将其与翻译指标一起纳入遗传算法进行多目标密码子优化;以 Trastuzumab 编码序列为概念验证,高丰度设计相对低丰度设计使胞内 mRNA 提高 41%、蛋白滴度提高 59%、细胞比生产率提高 85%,相对两家商业供应商基准序列滴度提高 70%、比生产率提高 98%,而活细胞密度相当。该研究将 mRNA 稳定性作为可调控的密码子优化设计参数,构建 IgG1 轻链同义编码序列组合文库并单拷贝整合到 CHO 细胞固定基因组位点,用 gDNA 与 mRNA 深度测序得到的稳态 mRNA 丰度作为稳定性代理指标,训练基于预训练核苷酸 transformer 嵌入的丰度预测模型,并将其与翻译指标一起纳入遗传算法进行多目标密码子优化;以 Trastuzumab 编码序列为概念验证,高丰度设计相对低丰度设计使胞内 mRNA 提高 41%、蛋白滴度提高 59%、细胞比生产率提高 85%,相对两家商业供应商基准序列滴度提高 70%、比生产率提高 98%,而活细胞密度相当。以 mRNA 稳定性为设计目标的序列优化提升 CHO 细胞中单克隆抗体产量该研究将 mRNA 稳定性作为可调控的密码子优化设计参数,构建 IgG1 轻链同义编码序列组合文库并单拷贝整合到 CHO 细胞固定基因组位点,用 gDNA 与 mRNA 深度测序得到的稳态 mRNA 丰度作为稳定性代理指标,训练基于预训练核苷酸 transformer 嵌入的丰度预测模型,并将其与翻译指标一起纳入遗传算法进行多目标密码子优化;以 Trastuzumab 编码序列为概念验证,高丰度设计相对低丰度设计使胞内 mRNA 提高 41%、蛋白滴度提高 59%、细胞比生产率提高 85%,相对两家商业供应商基准序列滴度提高 70%、比生产率提高 98%,而活细胞密度相当。该研究将 mRNA 稳定性作为可调控的密码子优化设计参数,构建 IgG1 轻链同义编码序列组合文库并单拷贝整合到 CHO 细胞固定基因组位点,用 gDNA 与 mRNA 深度测序得到的稳态 mRNA 丰度作为稳定性代理指标,训练基于预训练核苷酸 transformer 嵌入的丰度预测模型,并将其与翻译指标一起纳入遗传算法进行多目标密码子优化;以 Trastuzumab 编码序列为概念验证,高丰度设计相对低丰度设计使胞内 mRNA 提高 41%、蛋白滴度提高 59%、细胞比生产率提高 85%,相对两家商业供应商基准序列滴度提高 70%、比生产率提高 98%,而活细胞密度相当。