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研究进展

相关研究与后续进展

同一研究事件下的公开文章与后续进展。

bioRxiv

乘客共缺失混淆了以PTEN缺失为锚点的谷氨酰胺分解特征:位置感知特征设计的警示案例

该研究利用TCGA泛癌图谱的GISTIC拷贝数将肿瘤分为PTEN完整、半合子缺失和纯合缺失三档,在十四种肿瘤类型中评估一个五基因谷氨酰胺分解特征(GLS、SLC1A5、GOT1、GLUD1、GPT2),发现该特征随PTEN缺失而下降(十四种全部下降、十二种显著),但这一下降并非由MYC介导,而是由染色体位置决定:GLUD1与GOT1位于10q上与PTEN相邻,三十七个无谷氨酰胺分解注释的邻近基因与PTEN拷贝数的相关性与这两个基因相当(平均rho 0.843对0.842),共缺失保真度随与PTEN距离单调下降(rho = -0.993),校正全基因组非整倍体后关联不变,而以各基因自身拷贝数作条件则使